83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0852 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  100 
 
 
398 aa  786    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  51.88 
 
 
412 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  52.69 
 
 
391 aa  358  8e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  46.21 
 
 
389 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  43.38 
 
 
451 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  47.92 
 
 
359 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  43.53 
 
 
385 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  64.91 
 
 
238 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  67.68 
 
 
467 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  70 
 
 
249 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  66.97 
 
 
225 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  65.42 
 
 
234 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  36.1 
 
 
375 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  34.43 
 
 
397 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  67.39 
 
 
239 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  58.65 
 
 
216 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  59.05 
 
 
222 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  59 
 
 
209 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  36.95 
 
 
409 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  62 
 
 
272 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  36.31 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  74.07 
 
 
232 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  57.29 
 
 
164 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  59.81 
 
 
227 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  60.4 
 
 
231 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  52.88 
 
 
448 aa  129  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  56.48 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  35.13 
 
 
547 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  33.7 
 
 
400 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  38.91 
 
 
428 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  33.57 
 
 
473 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  35.38 
 
 
387 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  55.45 
 
 
445 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  34.1 
 
 
328 aa  123  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  33.93 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  35.27 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  35.27 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  31.59 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  35.71 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  35.71 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  35.71 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  33.21 
 
 
375 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  34.94 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  50.94 
 
 
460 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  33.94 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  60.24 
 
 
145 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  54.46 
 
 
243 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  53.54 
 
 
196 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  60 
 
 
258 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  52.38 
 
 
263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  55.81 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  31.48 
 
 
372 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  35.96 
 
 
436 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  32.62 
 
 
485 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  32.66 
 
 
439 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  57.5 
 
 
348 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  33.01 
 
 
495 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  46 
 
 
280 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  29.96 
 
 
389 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  28.63 
 
 
401 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  32.93 
 
 
362 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  35.74 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  33.47 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  25.28 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  34.06 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  32.8 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  45.71 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  33.2 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  35.56 
 
 
1995 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  28.41 
 
 
347 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  28.3 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  27.92 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  27.41 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  28.95 
 
 
295 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  29.31 
 
 
343 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  22 
 
 
320 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  27.46 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  25.15 
 
 
473 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  28.75 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  26.92 
 
 
275 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  26.53 
 
 
482 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  27.37 
 
 
356 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>