38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0458 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  54.72 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  46.25 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  71.15 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  66.67 
 
 		 412 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  69.52 
 
 		 359 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  67.65 
 
 		 451 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  62.62 
 
 		 389 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  67.35 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  64.76 
 
 		 467 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  67.92 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  38.46 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  62.96 
 
 		 391 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  65.62 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  65.31 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  57.94 
 
 		 398 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  65.05 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  41.44 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  63.46 
 
 		 445 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  64.95 
 
 		 145 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  67.02 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  61.46 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  47.86 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  50.39 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  58.43 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  57.58 
 
 		 348 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  54.81 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  51.04 
 
 		 448 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  57.73 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  57.32 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  51.04 
 
 		 460 aa  105  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  54.12 
 
 		 479 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  45.83 
 
 		 331 aa  96.3  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  54.88 
 
 		 282 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  53.75 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  44.79 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  31.48 
 
 		 1995 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  29.86 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>