39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0733 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  57.27 
 
 
225 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  64.08 
 
 
227 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  41.82 
 
 
234 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  67.02 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  64.21 
 
 
239 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  54.24 
 
 
398 aa  131  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  58.59 
 
 
164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  38.99 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  54.55 
 
 
232 aa  128  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  61.7 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  59.14 
 
 
412 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  60 
 
 
249 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  55.56 
 
 
467 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  60.82 
 
 
272 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  62.07 
 
 
391 aa  121  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  58.51 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  46.46 
 
 
145 aa  118  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  60.22 
 
 
445 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  46.72 
 
 
451 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  57.3 
 
 
258 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  42.96 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  38.12 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  50 
 
 
389 aa  115  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  62.5 
 
 
348 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  53.54 
 
 
243 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  53.66 
 
 
280 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  59.74 
 
 
196 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  54.64 
 
 
231 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  49.46 
 
 
448 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  57.97 
 
 
479 aa  89  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  43.01 
 
 
331 aa  88.2  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  60.32 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  46.07 
 
 
328 aa  78.2  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  49.38 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  29.88 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  39.19 
 
 
1995 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  38.1 
 
 
977 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0658423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>