37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0730 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  75 
 
 
280 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  54.55 
 
 
467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  55 
 
 
272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  57.58 
 
 
216 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  62.5 
 
 
220 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  51.52 
 
 
451 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  55.06 
 
 
164 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  58.75 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  53.54 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  57.5 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  60 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  52.34 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  57.5 
 
 
225 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  57.5 
 
 
398 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  56.25 
 
 
391 aa  110  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  58.75 
 
 
238 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  59.74 
 
 
239 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  54.26 
 
 
222 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  56.25 
 
 
145 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  48.08 
 
 
263 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  56.25 
 
 
227 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  55 
 
 
234 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  52.08 
 
 
231 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  58.9 
 
 
331 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  54.55 
 
 
209 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  56.25 
 
 
445 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  51.76 
 
 
196 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  50 
 
 
448 aa  96.7  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  53.75 
 
 
258 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  51.25 
 
 
243 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  54.43 
 
 
328 aa  89.7  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  52.86 
 
 
460 aa  80.1  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  41.77 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  43.75 
 
 
194 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  36.84 
 
 
222 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  35.06 
 
 
1995 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>