55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0989 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  680    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  55.09 
 
 
328 aa  360  1e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  31.56 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  34.94 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  31.72 
 
 
412 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  32.09 
 
 
391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  31.19 
 
 
451 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  33.33 
 
 
359 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  55 
 
 
348 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  45.83 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  45.1 
 
 
467 aa  92.8  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  51.19 
 
 
231 aa  92.4  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  43.88 
 
 
448 aa  89  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  49.43 
 
 
249 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  50.62 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  43.01 
 
 
220 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  44.34 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  44.68 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  46.25 
 
 
145 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  41.3 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  43.48 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  42.57 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  41.84 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  40.59 
 
 
243 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  42.68 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  45 
 
 
225 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  43.53 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  40.48 
 
 
164 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  54.55 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  49.28 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  43.9 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  40.82 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  42.03 
 
 
460 aa  67  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  31.91 
 
 
295 aa  59.7  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  32.74 
 
 
409 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  27.42 
 
 
401 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  34.51 
 
 
340 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  23.9 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  33.33 
 
 
479 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  25.97 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  33.63 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  23.42 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  27.9 
 
 
479 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  22.96 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  29.25 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  27.27 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  26.77 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  34.19 
 
 
461 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  27.97 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  27.68 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  30.25 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  25.4 
 
 
473 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  39.39 
 
 
474 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  33.73 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  34.18 
 
 
194 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>