117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  928    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  58.3 
 
 		 473 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  41.99 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  41.8 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  41.8 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  41.8 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  38.8 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  40.62 
 
 		 362 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  38.25 
 
 		 375 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  37.69 
 
 		 547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  39.09 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  39.09 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  37.09 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  38.56 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  35.8 
 
 		 485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  37.93 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  32.8 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  36.6 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  31.68 
 
 		 397 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  32.81 
 
 		 400 aa  167  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  34.77 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  35.78 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  32.84 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  32.85 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  29.01 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  65.12 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  32.3 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  66.67 
 
 		 231 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  33.82 
 
 		 398 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  59.52 
 
 		 350 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  64.47 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  62.03 
 
 		 222 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  56.67 
 
 		 228 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  58.82 
 
 		 205 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  45.38 
 
 		 212 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  66.67 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  56.79 
 
 		 211 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  60.53 
 
 		 192 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  56.79 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  64 
 
 		 205 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  55.56 
 
 		 466 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  52.08 
 
 		 223 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  56.58 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  60.26 
 
 		 228 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  27.68 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  32.87 
 
 		 391 aa  97.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  29.64 
 
 		 401 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  57.32 
 
 		 308 aa  96.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  53.85 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  53.85 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  53.85 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  56.96 
 
 		 171 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  29.87 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  29.21 
 
 		 416 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  56.96 
 
 		 176 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  56.96 
 
 		 118 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  56.96 
 
 		 118 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  56.96 
 
 		 118 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  55.7 
 
 		 224 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  49.46 
 
 		 682 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  55.7 
 
 		 111 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  49.51 
 
 		 106 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  58.23 
 
 		 107 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  60 
 
 		 188 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  53.75 
 
 		 181 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  53.66 
 
 		 274 aa  90.5  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  50.55 
 
 		 152 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  60 
 
 		 1409 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  50.55 
 
 		 152 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  53.33 
 
 		 170 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  51.9 
 
 		 170 aa  87  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  55.41 
 
 		 154 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  38.04 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  26.5 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  52 
 
 		 171 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  52 
 
 		 171 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  52 
 
 		 171 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  54.67 
 
 		 153 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  30.54 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  28.45 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  51.95 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  45.24 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  45.24 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  49.33 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  50.63 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  24.64 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  47.37 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  33.1 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  25.82 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  25.82 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  23.78 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  35.58 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  26.51 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  30.56 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  31.93 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  28.04 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  41.03 
 
 		 317 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  31.54 
 
 		 352 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  40.79 
 
 		 224 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  25.24 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>