87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4366 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  75.11 
 
 		 247 aa  331  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  39.53 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  38.19 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  40.78 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  34.76 
 
 		 317 aa  98.6  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  55.7 
 
 		 325 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  42.11 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  53.95 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  36.73 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  42.7 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  51.32 
 
 		 479 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  43.43 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  43.18 
 
 		 416 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  49.33 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  44.19 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  51.28 
 
 		 485 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  45.56 
 
 		 473 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  48.65 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  38.26 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  38.26 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  39.13 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  38.26 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  47.95 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  46.75 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  45.68 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  48.05 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  48.48 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  43.84 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  46.97 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  35.92 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  43.84 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  43.84 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  49.25 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  43.84 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  40.78 
 
 		 107 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  43.96 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  40.7 
 
 		 111 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  42.47 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  41.38 
 
 		 682 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  34.48 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  34.34 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  34.34 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  34.34 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  38.83 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  37.78 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  35.71 
 
 		 118 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  35.71 
 
 		 118 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  37.96 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  35.71 
 
 		 118 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  44.3 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  32.39 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  38.26 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  41.05 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  38.84 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  40.79 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  37.63 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  42.86 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  37.63 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  37.63 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  44.19 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  37.23 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  43.06 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  45.16 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  41.35 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  43.48 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  43.48 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  36.11 
 
 		 1409 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  43.48 
 
 		 547 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  40.58 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  37.33 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  40.85 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  40.24 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  39.24 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  40.58 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  37.21 
 
 		 407 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  40.21 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  42.17 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  40.59 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  36.94 
 
 		 375 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  36.59 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  45.45 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  41.43 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  37.21 
 
 		 409 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  42.65 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2170  transglycosylase domain-containing protein  38.46 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0606274  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2132  transglycosylase domain-containing protein  38.46 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00807725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>