More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4940 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 682 aa  1378    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  45.34 
 
 		 216 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  36.77 
 
 		 256 aa  127  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  47.73 
 
 		 220 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  47.33 
 
 		 251 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  47.33 
 
 		 251 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  47.33 
 
 		 251 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.06 
 
 		 554 aa  119  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  59.55 
 
 		 228 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.28 
 
 		 547 aa  113  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  65.38 
 
 		 211 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  44.19 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  44.19 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  50 
 
 		 326 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  63.64 
 
 		 466 aa  108  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  54.12 
 
 		 416 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  47.71 
 
 		 222 aa  107  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  65.33 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  47.2 
 
 		 346 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  46.56 
 
 		 288 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  52.85 
 
 		 251 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  47.54 
 
 		 224 aa  105  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  64 
 
 		 431 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  64 
 
 		 433 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  64 
 
 		 433 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  49.51 
 
 		 485 aa  103  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  60.47 
 
 		 350 aa  103  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  47.54 
 
 		 339 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  47.54 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  44.29 
 
 		 378 aa  102  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  47.54 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  47.54 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  41.48 
 
 		 447 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  59.52 
 
 		 228 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  41.48 
 
 		 447 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  42.54 
 
 		 323 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  50.41 
 
 		 320 aa  101  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  62.16 
 
 		 1409 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  46.4 
 
 		 406 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  41.13 
 
 		 171 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  41.13 
 
 		 171 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  42.98 
 
 		 424 aa  100  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.36 
 
 		 235 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  52.83 
 
 		 582 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  42.22 
 
 		 446 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  60.81 
 
 		 407 aa  100  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  42.98 
 
 		 424 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  42.98 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  42.98 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  45.9 
 
 		 339 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  42.98 
 
 		 421 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  42.98 
 
 		 423 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  42.98 
 
 		 417 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  42.98 
 
 		 423 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  42.98 
 
 		 417 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  44.72 
 
 		 199 aa  99  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  42.98 
 
 		 423 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  52.22 
 
 		 362 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  44.35 
 
 		 334 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  43.8 
 
 		 414 aa  98.6  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  52.27 
 
 		 547 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  41.22 
 
 		 220 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  47.93 
 
 		 348 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  46.72 
 
 		 332 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  52.33 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  52.33 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  52.33 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  52.27 
 
 		 348 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  52.27 
 
 		 348 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  45.08 
 
 		 340 aa  97.4  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  45.04 
 
 		 234 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  49.06 
 
 		 452 aa  96.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  45.9 
 
 		 340 aa  96.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  44.26 
 
 		 340 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  44.26 
 
 		 340 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  53.41 
 
 		 397 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  40.27 
 
 		 243 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  54.55 
 
 		 372 aa  95.5  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  45.45 
 
 		 351 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  33.53 
 
 		 491 aa  95.1  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  50.57 
 
 		 375 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  45.04 
 
 		 232 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  54.32 
 
 		 308 aa  94.4  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 375 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  49.46 
 
 		 461 aa  94.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  42.36 
 
 		 238 aa  94.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  57.69 
 
 		 400 aa  94  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.49 
 
 		 442 aa  94  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  36.8 
 
 		 564 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  47.11 
 
 		 458 aa  93.6  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  61.76 
 
 		 256 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  42.74 
 
 		 348 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  56.76 
 
 		 328 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  26.03 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  56.41 
 
 		 274 aa  92.4  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  41.01 
 
 		 424 aa  92  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  54.65 
 
 		 192 aa  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 231 aa  91.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  37.19 
 
 		 564 aa  90.9  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  37.19 
 
 		 564 aa  90.9  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>