48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2904 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  69.7 
 
 
256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  73.52 
 
 
216 aa  315  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  64.1 
 
 
220 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  49.17 
 
 
234 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  49.44 
 
 
232 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  47.16 
 
 
220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  41.44 
 
 
437 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  41.44 
 
 
437 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  54.43 
 
 
201 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  54.43 
 
 
199 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  54.43 
 
 
201 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  51.15 
 
 
322 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  53.72 
 
 
364 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  47.33 
 
 
682 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  53.72 
 
 
370 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  50.81 
 
 
365 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  50.81 
 
 
365 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  50.81 
 
 
365 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  39.37 
 
 
171 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  39.37 
 
 
171 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  38.89 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  33.62 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  32.54 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  39.84 
 
 
1048 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  37.1 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  32.85 
 
 
339 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  41.67 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  38.1 
 
 
434 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  37.5 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  39.51 
 
 
336 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  41.98 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  30.73 
 
 
317 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  36.45 
 
 
364 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  41.25 
 
 
357 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.33 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  32.38 
 
 
338 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  39.08 
 
 
767 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  32.38 
 
 
366 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  37.11 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  33.33 
 
 
347 aa  45.4  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  32.1 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  38.46 
 
 
526 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  31.18 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>