167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2328 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 256 aa  497  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  41.55 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  58.96 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  36.84 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  57.14 
 
 		 433 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  57.14 
 
 		 433 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  57.14 
 
 		 431 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  65.52 
 
 		 348 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  65.52 
 
 		 348 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  76.06 
 
 		 547 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  55.81 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  49.22 
 
 		 372 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  48.94 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  31.85 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  77.11 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  62.92 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  62.92 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  62.92 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  71.62 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  59.55 
 
 		 485 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  67.44 
 
 		 350 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  61.36 
 
 		 375 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  38.89 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  60.23 
 
 		 375 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  69.33 
 
 		 495 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  66.67 
 
 		 362 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  35.32 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  53.17 
 
 		 444 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  55.96 
 
 		 328 aa  111  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  59.78 
 
 		 211 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  69.01 
 
 		 466 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  69.86 
 
 		 416 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  33.19 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  59.05 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  67.12 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  67.57 
 
 		 461 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  62.82 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  55.06 
 
 		 397 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  61.46 
 
 		 106 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  57.89 
 
 		 400 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  61.76 
 
 		 682 aa  95.9  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  50.54 
 
 		 473 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  50.48 
 
 		 170 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  54.84 
 
 		 176 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  62.67 
 
 		 181 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  62.67 
 
 		 152 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  62.67 
 
 		 152 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  52.48 
 
 		 118 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  52.48 
 
 		 118 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  52.48 
 
 		 118 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  49.5 
 
 		 107 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  54.76 
 
 		 1409 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  46.67 
 
 		 170 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  63.24 
 
 		 188 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  50.96 
 
 		 111 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  57.5 
 
 		 387 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  50 
 
 		 171 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 171 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 171 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  58.82 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  45.87 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  57.35 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  37.93 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  46.75 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  47.22 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  39.53 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  40.35 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  44.29 
 
 		 97 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  45.71 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  30.61 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  51.92 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  42.86 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  52 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 168 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  47.46 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  46.97 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 123 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  33.33 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  43.33 
 
 		 158 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.26 
 
 		 155 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  41.33 
 
 		 416 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  49.02 
 
 		 157 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  50.98 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  46.94 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 1079 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  48 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1323  Peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.6395e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2902  Peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000393442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1623  Peptidoglycan-binding LysM  37.33 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000375126  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  39.74 
 
 		 427 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  40.3 
 
 		 145 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.92 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  45.45 
 
 		 149 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  47.92 
 
 		 145 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>