87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  100 
 
 		 350 aa  696    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  64.71 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  32.68 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  60.36 
 
 		 274 aa  133  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  63.27 
 
 		 222 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  73.12 
 
 		 192 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  76.71 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  65.26 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  65.26 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  65.26 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  64.56 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  69.23 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  59.78 
 
 		 228 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  72.22 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  69.23 
 
 		 228 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  61.62 
 
 		 107 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  62.63 
 
 		 106 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  56.57 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  53.27 
 
 		 205 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  59.52 
 
 		 461 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  52.63 
 
 		 176 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  66.25 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  72 
 
 		 256 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  62.96 
 
 		 205 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  59.77 
 
 		 171 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  59.77 
 
 		 171 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  59.77 
 
 		 171 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  52.59 
 
 		 118 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  52.59 
 
 		 118 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  52.59 
 
 		 118 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  56.6 
 
 		 111 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  59.49 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  59.49 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  59.49 
 
 		 547 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  58.97 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  57.5 
 
 		 485 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  57.32 
 
 		 473 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  60 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  61.84 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  61.84 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  61.84 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  50 
 
 		 181 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  60.53 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  50.47 
 
 		 152 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  50.47 
 
 		 152 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  56.7 
 
 		 212 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  62.2 
 
 		 171 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  60.47 
 
 		 682 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  59.21 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  64.86 
 
 		 188 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  56.25 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  62.16 
 
 		 1409 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  48.6 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  51.46 
 
 		 170 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  48.6 
 
 		 153 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  51.46 
 
 		 170 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  59.49 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  60.53 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  54.65 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  56.58 
 
 		 495 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  60.29 
 
 		 428 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  44.55 
 
 		 154 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  41.27 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  52.56 
 
 		 439 aa  79.3  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  42.28 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  48.72 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  40.52 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  45.95 
 
 		 225 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  52 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  38.46 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  48.1 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  46.84 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  47.89 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  41.03 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  44.87 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  34.38 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  43.04 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  39.81 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  41.38 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  42.11 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  39.19 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.64 
 
 		 279 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  40 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2005  cell wall-associated hydrolase  38.18 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00133091  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  43.08 
 
 		 128 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  38.64 
 
 		 126 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>