17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2649 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  100 
 
 
279 aa  569  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3310  hypothetical protein  38.18 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.100822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1754  CHAP domain-containing protein  34.55 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2088  cell wall-associated hydrolase  30.8 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.155991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2005  cell wall-associated hydrolase  43.24 
 
 
137 aa  77.8  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00133091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  34.13 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1369  hypothetical protein  34.25 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1988  hypothetical protein  31.58 
 
 
599 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.93 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5548  hypothetical protein  32.24 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352514  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  34.65 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2073  CHAP domain containing protein  28.86 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000221932  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  32.45 
 
 
491 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.06 
 
 
531 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2070  CHAP domain-containing protein  29.3 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0079  CHAP domain containing protein  28.48 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2328  hypothetical protein  30.37 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>