67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0750 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
531 aa  1110    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2010  hypothetical protein  48.98 
 
 
270 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0624267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2481  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.97 
 
 
497 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0485388  normal  0.126886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6382  hypothetical protein  46.74 
 
 
450 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136884  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  46.84 
 
 
513 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5958  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
455 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207674  decreased coverage  0.00749937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5766  hypothetical protein  37.91 
 
 
211 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.481702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.18 
 
 
393 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.94 
 
 
1089 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.46 
 
 
414 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  28.81 
 
 
358 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  50.77 
 
 
229 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.67 
 
 
280 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.27 
 
 
224 aa  54.7  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  46.67 
 
 
423 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  44.62 
 
 
239 aa  54.3  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.33 
 
 
306 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.88 
 
 
433 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  39.24 
 
 
762 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  46.88 
 
 
228 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.31 
 
 
283 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.76 
 
 
792 aa  51.2  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  32.95 
 
 
232 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  43.48 
 
 
224 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  42.19 
 
 
234 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 
243 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  43.08 
 
 
383 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  39.74 
 
 
204 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  33.06 
 
 
279 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.33 
 
 
306 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.21 
 
 
382 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.03 
 
 
536 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  47.54 
 
 
254 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  44.64 
 
 
379 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  40.58 
 
 
395 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  40.23 
 
 
462 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.83 
 
 
635 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 
160 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3696  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.51 
 
 
165 aa  47  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.04 
 
 
321 aa  47  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.47 
 
 
864 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.24 
 
 
206 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1369  hypothetical protein  35.42 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.19 
 
 
294 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  43.28 
 
 
236 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.62 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  39.08 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
322 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.62 
 
 
536 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
275 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.78 
 
 
327 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
266 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.18 
 
 
356 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.76 
 
 
319 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 
249 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  32.11 
 
 
258 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.1 
 
 
323 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
170 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.54 
 
 
200 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.87 
 
 
270 aa  44.3  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3310  hypothetical protein  35.48 
 
 
234 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.100822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.21 
 
 
310 aa  44.3  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  36.99 
 
 
383 aa  44.3  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  41.67 
 
 
381 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 
438 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.46 
 
 
249 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>