16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1754 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1754  CHAP domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3310  hypothetical protein  55 
 
 
234 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.100822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  44.94 
 
 
258 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1988  hypothetical protein  51.63 
 
 
599 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2073  CHAP domain containing protein  45.51 
 
 
344 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000221932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1369  hypothetical protein  43.23 
 
 
349 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5548  hypothetical protein  44.52 
 
 
359 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352514  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.94 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  34.55 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  30.43 
 
 
491 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1848  CHAP domain containing protein  29.65 
 
 
428 aa  48.5  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416568  normal  0.0942839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  32.93 
 
 
562 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1849  CHAP domain containing protein  25.53 
 
 
426 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.756572  normal  0.0939049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7462  PKD domain containing protein  27.1 
 
 
975 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2481  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.54 
 
 
497 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0485388  normal  0.126886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0079  CHAP domain containing protein  28.44 
 
 
228 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>