18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3072 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  100 
 
 
258 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1754  CHAP domain-containing protein  44.94 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3310  hypothetical protein  56.1 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.100822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2073  CHAP domain containing protein  46.15 
 
 
344 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000221932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1369  hypothetical protein  45.86 
 
 
349 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1988  hypothetical protein  43.31 
 
 
599 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5548  hypothetical protein  39.75 
 
 
359 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352514  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.19 
 
 
332 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  34.13 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1848  CHAP domain containing protein  28.07 
 
 
428 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416568  normal  0.0942839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0079  CHAP domain containing protein  30.28 
 
 
228 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  35.65 
 
 
491 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7462  PKD domain containing protein  28.28 
 
 
975 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  31.21 
 
 
562 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.11 
 
 
531 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6578  hypothetical protein  26.17 
 
 
128 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  31.78 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.39 
 
 
954 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>