286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2166 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
954 aa  1920    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.58 
 
 
232 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.8 
 
 
233 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  39.13 
 
 
206 aa  107  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  38.73 
 
 
153 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.85 
 
 
233 aa  105  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  37.01 
 
 
208 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.73 
 
 
232 aa  101  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  38.06 
 
 
208 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  38.06 
 
 
208 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  38.1 
 
 
153 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  38.1 
 
 
153 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  37.06 
 
 
179 aa  97.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  36.43 
 
 
148 aa  97.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  39.1 
 
 
136 aa  95.9  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  34.19 
 
 
159 aa  96.3  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  35.92 
 
 
634 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  36.84 
 
 
136 aa  93.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  35.77 
 
 
199 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  35.81 
 
 
186 aa  92.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  37.59 
 
 
136 aa  91.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  40.91 
 
 
1523 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.71 
 
 
568 aa  85.5  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3574  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.69 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  40.52 
 
 
247 aa  79.7  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  38.14 
 
 
448 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  36.8 
 
 
242 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  38.17 
 
 
456 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  41.18 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  39.52 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  43.97 
 
 
799 aa  72  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  37.57 
 
 
744 aa  72  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.57 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2852  hypothetical protein  30.09 
 
 
335 aa  70.5  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  40.21 
 
 
723 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  36.99 
 
 
744 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  38.53 
 
 
260 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  33.33 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  40.74 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  40.16 
 
 
258 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  35.03 
 
 
302 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  40.22 
 
 
290 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30.57 
 
 
341 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  33.33 
 
 
499 aa  67  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.94 
 
 
224 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  33.67 
 
 
1084 aa  65.9  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.8 
 
 
429 aa  66.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  30.73 
 
 
1066 aa  65.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  41.96 
 
 
234 aa  65.1  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.01 
 
 
448 aa  65.1  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  39.13 
 
 
247 aa  64.7  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  36.21 
 
 
643 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  39.18 
 
 
466 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  41.3 
 
 
227 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  40.3 
 
 
896 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  37.39 
 
 
534 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  38.71 
 
 
264 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  34.13 
 
 
1309 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  30.61 
 
 
921 aa  61.6  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  27.88 
 
 
301 aa  61.6  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  31.86 
 
 
250 aa  61.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  31.73 
 
 
922 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  41.38 
 
 
1126 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.43 
 
 
913 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  32.43 
 
 
1051 aa  60.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  37.12 
 
 
197 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  36.84 
 
 
1442 aa  60.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.04 
 
 
617 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  28.78 
 
 
423 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  37.36 
 
 
1403 aa  59.7  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  37.86 
 
 
909 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  29.85 
 
 
1079 aa  59.3  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  31.93 
 
 
1137 aa  59.3  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  32.33 
 
 
509 aa  58.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  31.47 
 
 
602 aa  58.9  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  30.4 
 
 
274 aa  58.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  53.7 
 
 
285 aa  58.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  44.23 
 
 
323 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  37.39 
 
 
306 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  28.86 
 
 
287 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  34.51 
 
 
436 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  29.35 
 
 
337 aa  57  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  33.03 
 
 
409 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  57.45 
 
 
190 aa  56.2  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  43.28 
 
 
235 aa  56.2  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  41.41 
 
 
402 aa  55.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  32.73 
 
 
1086 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.07 
 
 
457 aa  55.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  35.23 
 
 
733 aa  55.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  51.02 
 
 
558 aa  55.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  37.5 
 
 
1217 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  32.87 
 
 
1079 aa  55.5  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  38.05 
 
 
449 aa  55.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  28.46 
 
 
1246 aa  55.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  33.52 
 
 
642 aa  55.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.39 
 
 
546 aa  55.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.08 
 
 
334 aa  55.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  28.3 
 
 
189 aa  54.7  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  28.79 
 
 
1219 aa  54.7  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>