15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3310 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3310  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1754  CHAP domain-containing protein  55 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  56.1 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1988  hypothetical protein  45.81 
 
 		 599 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2073  CHAP domain containing protein  43.23 
 
 		 344 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000221932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1369  hypothetical protein  40.65 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5548  hypothetical protein  41.29 
 
 		 359 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352514  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.26 
 
 		 332 aa  85.5  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  38.18 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  33.65 
 
 		 562 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  28.07 
 
 		 491 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.48 
 
 		 531 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0926  hypothetical protein  30.67 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000156201  unclonable  0.00000000000301001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0079  CHAP domain containing protein  29.36 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7462  PKD domain containing protein  33.68 
 
 		 975 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>