18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2481 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2481  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 497 aa  1012    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0485388  normal  0.126886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.97 
 
 		 531 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2010  hypothetical protein  43.44 
 
 		 270 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0624267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6382  hypothetical protein  47.03 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  44.64 
 
 		 513 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5958  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.11 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207674  decreased coverage  0.00749937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5766  hypothetical protein  40.96 
 
 		 211 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.481702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2070  CHAP domain-containing protein  38.67 
 
 		 150 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0926  hypothetical protein  32.75 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000156201  unclonable  0.00000000000301001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2656  CHAP domain-containing protein  27.8 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1833  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 148 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0439402  hitchhiker  0.00000000491312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  28.96 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 		 792 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  33.67 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.82 
 
 		 283 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  44.07 
 
 		 228 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3167  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 272 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00456711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>