68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3726 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  789    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5958  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207674  decreased coverage  0.00749937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6382  hypothetical protein  36.13 
 
 		 450 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5766  hypothetical protein  40.12 
 
 		 211 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.481702 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  37.44 
 
 		 513 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.39 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2010  hypothetical protein  33.86 
 
 		 270 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0624267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2481  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.46 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0485388  normal  0.126886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0662  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.75 
 
 		 464 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.18 
 
 		 531 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  36.89 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  40 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2233  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.22 
 
 		 251 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.9 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  38.95 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.9 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.9 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 		 243 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  40.68 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  38.3 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  35.51 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  42.25 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  31.62 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.9 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  41.79 
 
 		 438 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  31.62 
 
 		 462 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.02 
 
 		 327 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  46.3 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  44.26 
 
 		 405 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  31.62 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 232 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  48.21 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  38.33 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  45.45 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  34.94 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.23 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  37.97 
 
 		 239 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.58 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.77 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  47.37 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 478 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  50.98 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  41.1 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1961  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.81 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.51 
 
 		 549 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  47.06 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.44 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.94 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.02 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 234 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.86 
 
 		 263 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.98 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.59 
 
 		 864 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0971  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 		 591 aa  42.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  40.62 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>