103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0066 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 346 aa  686    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  99.39 
 
 		 356 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  82.95 
 
 		 346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  82.66 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  69.83 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  74.56 
 
 		 299 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  68.09 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.98 
 
 		 273 aa  278  7e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  43.64 
 
 		 264 aa  223  4e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.99 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  41.76 
 
 		 277 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  42.66 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  44.69 
 
 		 268 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  43.12 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  41.42 
 
 		 277 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  42.66 
 
 		 275 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  42.66 
 
 		 275 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  42.66 
 
 		 275 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  42.66 
 
 		 275 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  42.66 
 
 		 275 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  42.66 
 
 		 275 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  42.79 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  34.78 
 
 		 267 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  34.78 
 
 		 270 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  34.39 
 
 		 267 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  34.54 
 
 		 271 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  36.27 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  40.85 
 
 		 217 aa  90.1  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  29.29 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  44.44 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  51.72 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.1 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 327 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 		 398 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 		 398 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  33.93 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.9 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  39.44 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  51.85 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  46.3 
 
 		 415 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  42.25 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  57.45 
 
 		 413 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  51.06 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  38.67 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  61.76 
 
 		 61 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  46.43 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  43.28 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  47.27 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 1072 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  55.32 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.18 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  46 
 
 		 482 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.47 
 
 		 1226 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  41.82 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.08 
 
 		 116 aa  46.2  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 434 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  36.67 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  36.67 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  53.19 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  36.67 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  41.51 
 
 		 480 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.3 
 
 		 1263 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2233  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.73 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 1261 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  34.38 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  35.59 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4612  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.51 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  36.67 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.3 
 
 		 1260 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.07 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  41.82 
 
 		 2277 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  34.38 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.38 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  42.59 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  38.96 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.96 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.1 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  45.1 
 
 		 434 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  42.59 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.42 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 77 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  47.06 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 667 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 508 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  56.67 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  43.48 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.3 
 
 		 433 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  36.36 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3803  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.06 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633002  normal  0.020318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>