295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3195 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  57.44 
 
 
242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  61.72 
 
 
228 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  52.27 
 
 
239 aa  238  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  48.02 
 
 
236 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  49.28 
 
 
234 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  53.81 
 
 
225 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  45.06 
 
 
228 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  52.33 
 
 
233 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  44.21 
 
 
231 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  44.6 
 
 
247 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.18 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.18 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.18 
 
 
259 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  41.33 
 
 
259 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.91 
 
 
253 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.75 
 
 
253 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  39.75 
 
 
253 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.75 
 
 
253 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.75 
 
 
253 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  38.91 
 
 
253 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  36.6 
 
 
267 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  37.31 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  61.07 
 
 
163 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  39.46 
 
 
224 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  38.53 
 
 
229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  58.62 
 
 
185 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  36.14 
 
 
267 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  58.41 
 
 
201 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  50.39 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  55.46 
 
 
190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  45.51 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  48.72 
 
 
165 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  45.19 
 
 
242 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  48.74 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  48.25 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  45.05 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  49.14 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  45.3 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  47.93 
 
 
239 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  53.64 
 
 
231 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35.14 
 
 
546 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  38.22 
 
 
208 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  47.01 
 
 
253 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  43.1 
 
 
265 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  43.1 
 
 
265 aa  101  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  43.1 
 
 
265 aa  101  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  43.1 
 
 
265 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  43.1 
 
 
265 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  45.6 
 
 
203 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  43.1 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  42.24 
 
 
265 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  42.24 
 
 
265 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  45.83 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  42.24 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  43.97 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  41.38 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  43.1 
 
 
197 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  35.44 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 
304 aa  91.7  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  42.86 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  38.6 
 
 
200 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  38.6 
 
 
200 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  45.05 
 
 
277 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  36.97 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  36.67 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  38.26 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.68 
 
 
433 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  38.71 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  28.47 
 
 
189 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.28 
 
 
77 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  33.02 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.16 
 
 
160 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  30.47 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  32.79 
 
 
400 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.03 
 
 
391 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.28 
 
 
270 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
412 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.67 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.55 
 
 
422 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.46 
 
 
321 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.18 
 
 
360 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.82 
 
 
508 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  44.64 
 
 
406 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  35.2 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39 
 
 
245 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  37.08 
 
 
409 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  44.64 
 
 
396 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.35 
 
 
575 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.66 
 
 
309 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  46.03 
 
 
324 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
163 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 
587 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.77 
 
 
280 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1791  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.33 
 
 
168 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 
395 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  44.64 
 
 
383 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>