156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1251 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  68.33 
 
 
216 aa  317  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  44.14 
 
 
194 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  42.33 
 
 
197 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  39.41 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  34.69 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  37.57 
 
 
203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  41.36 
 
 
265 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  40.84 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  40.84 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  40.84 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  40.84 
 
 
265 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  40 
 
 
265 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  40 
 
 
265 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  40 
 
 
265 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  40 
 
 
265 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  40 
 
 
265 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  34.01 
 
 
239 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  35.11 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  33.5 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  35.45 
 
 
216 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
546 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  31.7 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  35.05 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  30.64 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  33.51 
 
 
261 aa  104  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  34.03 
 
 
253 aa  104  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  37.89 
 
 
267 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  32.88 
 
 
231 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  40.41 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  37.31 
 
 
239 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  30.69 
 
 
208 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  28.22 
 
 
224 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  40.98 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  38.73 
 
 
201 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
165 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  37.41 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  42.02 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  37.9 
 
 
267 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  31.34 
 
 
277 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  41.18 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  42.28 
 
 
225 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  35.48 
 
 
163 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  34.2 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  30.85 
 
 
304 aa  85.9  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  34.21 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  33.97 
 
 
236 aa  85.1  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  44.17 
 
 
190 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  35.77 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  42.11 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  36.49 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  40.15 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  30.57 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  36.97 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  38.14 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  38.52 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  36.36 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  37.21 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  33.56 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  35.21 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.5 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  37.5 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.5 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.5 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.5 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.5 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.5 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.5 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  34.85 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.1 
 
 
797 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  33.61 
 
 
412 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  32.69 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  30.51 
 
 
429 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 
179 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  31.03 
 
 
338 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  33.62 
 
 
220 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  32.73 
 
 
377 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  40.32 
 
 
571 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  38.37 
 
 
429 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  33.02 
 
 
519 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  35.37 
 
 
495 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  32.76 
 
 
282 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  28.85 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  29.01 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  29.84 
 
 
375 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  29.77 
 
 
409 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  28.35 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  29.77 
 
 
402 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  28.18 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  31.5 
 
 
301 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  31.5 
 
 
301 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  30.49 
 
 
479 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
544 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  38.57 
 
 
380 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  29.41 
 
 
383 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.62 
 
 
534 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.3 
 
 
579 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  46.15 
 
 
409 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  30.33 
 
 
290 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  29.25 
 
 
410 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>