115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4305 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
412 aa  830    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  46.12 
 
 
375 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  46.83 
 
 
409 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  40.25 
 
 
376 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  40.91 
 
 
380 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  44.75 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  47.4 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  50.41 
 
 
255 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  51.18 
 
 
429 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  50.78 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 
433 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  48.44 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  47.58 
 
 
410 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  48.46 
 
 
301 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  48.46 
 
 
301 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  48.44 
 
 
301 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  41.99 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  49.25 
 
 
409 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  46.92 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  47.1 
 
 
245 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  46.92 
 
 
466 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  44.96 
 
 
476 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  42.65 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  44.19 
 
 
476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  44.19 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  42.64 
 
 
496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  43.09 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  42.64 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  41.73 
 
 
383 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  40.48 
 
 
230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  34.97 
 
 
214 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  37.8 
 
 
207 aa  96.3  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  40.62 
 
 
240 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  37.91 
 
 
240 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  39.06 
 
 
228 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  38.76 
 
 
220 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  39.37 
 
 
221 aa  86.7  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  32.28 
 
 
203 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  32.28 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  31.5 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  32.28 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  32.26 
 
 
179 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  29.84 
 
 
208 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  36.51 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2760  hypothetical protein  52.83 
 
 
136 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  30.2 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  30.2 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  30.2 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  30.2 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  30.2 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  29.53 
 
 
265 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  29.79 
 
 
265 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  27.5 
 
 
265 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  31.62 
 
 
186 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  33.58 
 
 
187 aa  60.1  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  28.19 
 
 
265 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  28.19 
 
 
265 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  32.14 
 
 
228 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  30.38 
 
 
245 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  36.07 
 
 
235 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  34.96 
 
 
222 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  32.45 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  31.25 
 
 
189 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  27.22 
 
 
185 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  29.85 
 
 
287 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  29.49 
 
 
245 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  29.49 
 
 
245 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  30.95 
 
 
259 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  32.8 
 
 
166 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  30.46 
 
 
234 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  32.33 
 
 
546 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.16 
 
 
259 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.16 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  30.16 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  30.16 
 
 
253 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.16 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.16 
 
 
259 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.16 
 
 
259 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.16 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.16 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  30.43 
 
 
278 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  26.56 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  46.51 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 
169 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  29.69 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  38.6 
 
 
169 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  33.6 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  41.18 
 
 
169 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  30.34 
 
 
194 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.37 
 
 
247 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  35.06 
 
 
242 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  31.78 
 
 
241 aa  46.6  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  32.99 
 
 
233 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  27.08 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  33.33 
 
 
231 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  25.78 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  27.27 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  29.5 
 
 
197 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>