132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0552 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 		 409 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  90.46 
 
 		 402 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  62.47 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  52.27 
 
 		 377 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  49.63 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  48.27 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  59.51 
 
 		 383 aa  262  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  47.94 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  55.47 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  52.27 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  53.12 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  54.69 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  48.1 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  52.34 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  52.34 
 
 		 472 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  41.79 
 
 		 365 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  53.08 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  50.78 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  38.43 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  49.61 
 
 		 496 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  48.32 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  53.54 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  53.54 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  48 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  52.31 
 
 		 245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  49.25 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  37.77 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  44.53 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 214 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  42.65 
 
 		 230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  43.54 
 
 		 240 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  43.54 
 
 		 240 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 228 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  46.4 
 
 		 179 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  45.53 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  41.94 
 
 		 229 aa  106  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  40.43 
 
 		 220 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  37.8 
 
 		 207 aa  94.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  39.37 
 
 		 221 aa  93.6  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  37.4 
 
 		 203 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  37.4 
 
 		 203 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  37.4 
 
 		 217 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  36.59 
 
 		 203 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  34.35 
 
 		 208 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  38.85 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  35.66 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  41.98 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  30.77 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  32.35 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  33.09 
 
 		 265 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  46.27 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  33.09 
 
 		 265 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  30.53 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  31.62 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  50 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  33.09 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  33.09 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  33.09 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  33.09 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  45.61 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  59.57 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  33.09 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  31.62 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  32.82 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  31.2 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  31.78 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  57.45 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  32.17 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  49.02 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  32.12 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  31.3 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  34.35 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  31.65 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.01 
 
 		 259 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.01 
 
 		 253 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  29.01 
 
 		 253 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  29.01 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  32.82 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.01 
 
 		 253 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  30.08 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.01 
 
 		 253 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  31.01 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.01 
 
 		 259 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.01 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.77 
 
 		 259 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.01 
 
 		 253 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  31.45 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  31.39 
 
 		 194 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  53.33 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  53.19 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  29.41 
 
 		 152 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  29.32 
 
 		 239 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  31.5 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  32.86 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  32.86 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  32.81 
 
 		 245 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  36.27 
 
 		 169 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>