114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2361 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1012    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  64.75 
 
 		 476 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  61.72 
 
 		 472 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  61.32 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  60.24 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  60.16 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  58.55 
 
 		 460 aa  542  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  66.44 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  56.69 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  56 
 
 		 391 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  56.8 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  50.36 
 
 		 301 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  51.85 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  50.36 
 
 		 301 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  51.94 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  52.27 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  51.16 
 
 		 404 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  49.63 
 
 		 365 aa  156  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  50.39 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  51.16 
 
 		 301 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  51.47 
 
 		 377 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  49.61 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  53.6 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  45.21 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  44.03 
 
 		 214 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  47.58 
 
 		 230 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 		 229 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  44.06 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  42.45 
 
 		 245 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  42.64 
 
 		 412 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  42.65 
 
 		 380 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  41.6 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  45.16 
 
 		 240 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  45.16 
 
 		 240 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  39.22 
 
 		 376 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  45.16 
 
 		 221 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  43.55 
 
 		 228 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  43.31 
 
 		 179 aa  97.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  40.31 
 
 		 220 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  36.8 
 
 		 207 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  36.29 
 
 		 203 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  35.66 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  35.71 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  34.92 
 
 		 203 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  30.98 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  33.87 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  36.73 
 
 		 187 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  32.86 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  31.54 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  32.26 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  33.59 
 
 		 231 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.26 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  32.31 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 326 aa  57  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.26 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.26 
 
 		 259 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.79 
 
 		 253 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  32.79 
 
 		 253 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  32.26 
 
 		 253 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.79 
 
 		 253 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  50.91 
 
 		 278 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  40.3 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.75 
 
 		 253 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.26 
 
 		 253 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 287 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  31.11 
 
 		 315 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  32.06 
 
 		 153 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  53.19 
 
 		 284 aa  53.9  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  31.97 
 
 		 247 aa  53.9  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 326 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  33.88 
 
 		 234 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  32.26 
 
 		 245 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  32.79 
 
 		 267 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  33.61 
 
 		 546 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  51.11 
 
 		 169 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 169 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  30.83 
 
 		 216 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  30.65 
 
 		 245 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  30.65 
 
 		 245 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  38.24 
 
 		 310 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  49.02 
 
 		 239 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  31.97 
 
 		 270 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 		 241 aa  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  30.83 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  36.59 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  30.82 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  28.69 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  31.67 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  44.83 
 
 		 242 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  27.05 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  55.81 
 
 		 165 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  25.45 
 
 		 235 aa  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  27.52 
 
 		 265 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  29.03 
 
 		 229 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  31.45 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  31.58 
 
 		 265 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  31.58 
 
 		 265 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  34.07 
 
 		 265 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  31.58 
 
 		 265 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>