133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0378 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  890    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  87.88 
 
 
429 aa  791    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  49.21 
 
 
391 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  49.63 
 
 
402 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  54.85 
 
 
377 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  49.63 
 
 
409 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  39.75 
 
 
383 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  59.84 
 
 
460 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  58.21 
 
 
433 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  57.69 
 
 
410 aa  170  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  58.27 
 
 
466 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  49.69 
 
 
365 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  55.3 
 
 
476 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  56.69 
 
 
496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  59.06 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  55.22 
 
 
476 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  58.27 
 
 
301 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  58.27 
 
 
301 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  57.25 
 
 
446 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  58.27 
 
 
404 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  54.48 
 
 
474 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  56.69 
 
 
472 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  54.89 
 
 
375 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  54.33 
 
 
432 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  42.71 
 
 
412 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  50.77 
 
 
245 aa  136  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  53.08 
 
 
409 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  40.29 
 
 
228 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  46.46 
 
 
380 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  48.41 
 
 
230 aa  126  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  46.26 
 
 
240 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  43.85 
 
 
376 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  46.26 
 
 
240 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  45.53 
 
 
255 aa  120  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  43.61 
 
 
214 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  45.97 
 
 
229 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  44.96 
 
 
220 aa  107  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  45.32 
 
 
221 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  37.97 
 
 
179 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  38.21 
 
 
203 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  39.02 
 
 
203 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  39.02 
 
 
217 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  34.71 
 
 
207 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  37.4 
 
 
203 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  33.86 
 
 
208 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  41.67 
 
 
186 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  39.39 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  33.86 
 
 
209 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  33.08 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  33.08 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  32.64 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  34.35 
 
 
235 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  39.37 
 
 
546 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  25.43 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  32.58 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  25.43 
 
 
253 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  25.43 
 
 
253 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  25.43 
 
 
253 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  25.43 
 
 
253 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  25.43 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  34.25 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  31.01 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  34.68 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.82 
 
 
259 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
245 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  31.82 
 
 
259 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  35.94 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.82 
 
 
259 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.82 
 
 
259 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
245 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  32.59 
 
 
265 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  32.59 
 
 
265 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  32.59 
 
 
265 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  32.17 
 
 
239 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  34.56 
 
 
234 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  33.33 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  31.5 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  32.85 
 
 
265 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  31.85 
 
 
265 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  33.06 
 
 
231 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  33.59 
 
 
226 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  33.61 
 
 
239 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  34.65 
 
 
163 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  31.58 
 
 
286 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  30.47 
 
 
189 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  33.87 
 
 
235 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  32.52 
 
 
228 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  30 
 
 
185 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  32.56 
 
 
245 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  34.92 
 
 
229 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  35.82 
 
 
264 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  30.47 
 
 
165 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  31.5 
 
 
216 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  31.54 
 
 
241 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  47.06 
 
 
284 aa  57  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>