95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1044 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 380 aa  770    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  52.8 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  40.91 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  47.62 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  50.35 
 
 		 375 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  46.46 
 
 		 429 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  45.31 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  46.4 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  37.25 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  44.53 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  45.8 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  46.77 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  45.8 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  43.97 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  37.84 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  43.61 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  36.84 
 
 		 466 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  41.43 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  42.65 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  38.02 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 		 460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  36.55 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  36.72 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  42.42 
 
 		 245 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  38.57 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  41.98 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  41.98 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  41.98 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  40.58 
 
 		 432 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  41.41 
 
 		 230 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  38.76 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  40.94 
 
 		 214 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  43.65 
 
 		 240 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  43.65 
 
 		 240 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 228 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  39.34 
 
 		 229 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  39.02 
 
 		 179 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  40.62 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  33.6 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  37.3 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  39.37 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  36.07 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  36.07 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  31.52 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  33.61 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  36.64 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  33.83 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  34.96 
 
 		 235 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2760  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  34.68 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  34.68 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  33.06 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  31.45 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  31.71 
 
 		 169 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  29.84 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  35.78 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  29.69 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  36.63 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  28.36 
 
 		 169 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  45.59 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  30.95 
 
 		 186 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  31.62 
 
 		 129 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  32 
 
 		 208 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  22.33 
 
 		 265 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  21.86 
 
 		 265 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  32.56 
 
 		 187 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  56.82 
 
 		 228 aa  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  29.36 
 
 		 185 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  26.53 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  25.71 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  26.81 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  29.92 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  26.09 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  26.09 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  26.09 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  26.09 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  26.09 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  46.43 
 
 		 163 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  30.33 
 
 		 197 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  38.57 
 
 		 222 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  49.02 
 
 		 233 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  28.99 
 
 		 235 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  31.2 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  30.71 
 
 		 239 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  32.35 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  37.31 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  39.66 
 
 		 208 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  30.28 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  38.24 
 
 		 239 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 231 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1136 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  39.39 
 
 		 270 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>