134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0646 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  81.4 
 
 		 240 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  81.82 
 
 		 240 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  48.44 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  41.6 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  44.62 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  57.69 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  40.29 
 
 		 429 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  43.87 
 
 		 383 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  37.86 
 
 		 429 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  47.29 
 
 		 375 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  36.84 
 
 		 391 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  35.78 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 		 409 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  41.83 
 
 		 377 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  38.27 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  44.72 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  36.87 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  42.18 
 
 		 402 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  40.37 
 
 		 365 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  45.38 
 
 		 433 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  43.55 
 
 		 496 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  42.36 
 
 		 409 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  38.93 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  36.04 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  43.28 
 
 		 410 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  41.54 
 
 		 466 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  43.18 
 
 		 446 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  41.94 
 
 		 476 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  43.08 
 
 		 404 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  44.36 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  41.27 
 
 		 472 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  40.94 
 
 		 476 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  42.74 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  38.89 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  38.89 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  41.94 
 
 		 460 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  40.48 
 
 		 474 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  38.1 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  41.94 
 
 		 432 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  39.2 
 
 		 376 aa  92.4  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  39.06 
 
 		 412 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  39.34 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  39.84 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  36.8 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  36.72 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  39.17 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  34.4 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  34.4 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  36.36 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  35 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  34.15 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  32.52 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  33.09 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  35.54 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  33.82 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 286 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  36.97 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  32 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  32.23 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  35.25 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  32.77 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  28.99 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  36 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  34.48 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  31.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  35.77 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  33.63 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  31.93 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  32.84 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  33.08 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  34.15 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1369  hypothetical protein  33.53 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238194 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  26.32 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  32.71 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  39.56 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  32.74 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  37.35 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  26.32 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  30.33 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  40.23 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  32.03 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  28.78 
 
 		 165 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  28.83 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  44.23 
 
 		 326 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  27.01 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.33 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  27.01 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  27.01 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  28.33 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  27.01 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  32.56 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  27.01 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.33 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.33 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.75 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>