68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1369 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1369  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  968    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  36.69 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1136 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  32.73 
 
 		 203 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  32.76 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  32.76 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  31.21 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  26.94 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0810  hypothetical protein  38.64 
 
 		 236 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  28.67 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  32.43 
 
 		 429 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  33.53 
 
 		 228 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  34.51 
 
 		 240 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  34.51 
 
 		 240 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  31.76 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  30.25 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  30.25 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  30.08 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  30.94 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  26.7 
 
 		 208 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  29.1 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  30.08 
 
 		 301 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5166  cell wall hydrolase SleB  30.99 
 
 		 250 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  30.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0248  hypothetical protein  37.21 
 
 		 201 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  29.61 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  30.43 
 
 		 197 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  31.13 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  32.12 
 
 		 546 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  32.82 
 
 		 179 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  28.44 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  27.78 
 
 		 234 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  27.37 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  27.37 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  27.37 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  28.57 
 
 		 253 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.57 
 
 		 253 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  28.05 
 
 		 259 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  32.17 
 
 		 267 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  30.6 
 
 		 230 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  29.93 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  27.78 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  32.17 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  28.86 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28 
 
 		 253 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28 
 
 		 253 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  28 
 
 		 253 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  28.95 
 
 		 247 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  30.41 
 
 		 220 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  30.3 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  29.41 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  28.03 
 
 		 235 aa  47.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  28.76 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  30.72 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  31.01 
 
 		 186 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  29.19 
 
 		 224 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  28.89 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  31.58 
 
 		 187 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  28.86 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  29.01 
 
 		 209 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  30.08 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  32.85 
 
 		 261 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  31.11 
 
 		 229 aa  44.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  29.29 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  28.08 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  30.88 
 
 		 185 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  30.6 
 
 		 228 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>