204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0894 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 
235 aa  480  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  58.42 
 
 
239 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  56.04 
 
 
216 aa  207  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  58.47 
 
 
203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  45.6 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  46.56 
 
 
310 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  44.86 
 
 
286 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  37.71 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  43.18 
 
 
197 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  47.78 
 
 
261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  50.96 
 
 
229 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  44.38 
 
 
546 aa  144  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  39.32 
 
 
208 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  43.48 
 
 
253 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  35.9 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  33.65 
 
 
222 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  54.47 
 
 
197 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  40.99 
 
 
165 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  39.89 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  38.98 
 
 
264 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  40.43 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  46.88 
 
 
224 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  37.43 
 
 
265 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  49.58 
 
 
239 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  38.79 
 
 
231 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  36.9 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  35.14 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  35.14 
 
 
265 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  35.14 
 
 
265 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  35.14 
 
 
265 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  35.14 
 
 
265 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  36.73 
 
 
201 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  35.52 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  43.8 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  46.28 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  46.67 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  34.97 
 
 
265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  47.41 
 
 
228 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  46.67 
 
 
236 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  46.22 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  34.97 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  45 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  45.38 
 
 
185 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  44.17 
 
 
259 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.17 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.17 
 
 
253 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  40.91 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.17 
 
 
253 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  44.17 
 
 
253 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.17 
 
 
253 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.17 
 
 
259 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.17 
 
 
259 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.17 
 
 
259 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  32.2 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  45.69 
 
 
233 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  48.28 
 
 
242 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  36.52 
 
 
304 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  38.04 
 
 
262 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  48.76 
 
 
163 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  50 
 
 
225 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  46.83 
 
 
228 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  37.7 
 
 
200 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  44.35 
 
 
231 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  37.7 
 
 
200 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  44.63 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  44.07 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  47.06 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  37.01 
 
 
400 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  30.21 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  35.71 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  33.54 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  34.68 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  33.08 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  34.68 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  33.87 
 
 
429 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  35.48 
 
 
375 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  30.92 
 
 
460 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  38.52 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  32.8 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  31.72 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  34.4 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  34.4 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  34.4 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  49.21 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  33.06 
 
 
429 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  28.29 
 
 
466 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  28.29 
 
 
476 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  30.95 
 
 
391 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  35.94 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  32.5 
 
 
179 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
341 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  35.06 
 
 
324 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  33.07 
 
 
433 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 
419 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  51.16 
 
 
498 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 
544 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  32.03 
 
 
402 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  56.86 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>