More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2798 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  45.56 
 
 		 267 aa  215  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  47.08 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  37.62 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  42.71 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  34.47 
 
 		 546 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  37.6 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  41.75 
 
 		 239 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  35.16 
 
 		 264 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  40.76 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  32.55 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  39.89 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  37.93 
 
 		 216 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  39.58 
 
 		 203 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  39.68 
 
 		 197 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  38.7 
 
 		 194 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  32.16 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  32 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  32.73 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  32.73 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  32.73 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  36.19 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  32.73 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  32.73 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  37.3 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  32.55 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  37.35 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  32.55 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  32.16 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  30.04 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  41.82 
 
 		 165 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  40.94 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  50 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  47.01 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  56.04 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  39.72 
 
 		 197 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  45.13 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  52.21 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  42.37 
 
 		 185 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  34.5 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  40.46 
 
 		 233 aa  96.3  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  42.61 
 
 		 242 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  43.75 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  38.16 
 
 		 224 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  50.54 
 
 		 228 aa  92.4  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  34.62 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  41.38 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  39.82 
 
 		 201 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.46 
 
 		 324 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.68 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.03 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.68 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  40.68 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  40.68 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.68 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.68 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.68 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.68 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  36.3 
 
 		 503 aa  89.4  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  39.83 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  31.34 
 
 		 222 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  45.05 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  40.54 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  43.59 
 
 		 163 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  32.34 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  38.14 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  39.83 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  39.64 
 
 		 200 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  48.39 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  38.68 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  37.4 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  44.35 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  41.35 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  37.74 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  37.67 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  37.74 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  36 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 797 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 		 733 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.77 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  37.82 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  40.57 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 142 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 527 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  39.81 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  39.81 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  33.33 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.61 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  36.79 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  33.8 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.29 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  37.07 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.75 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>