217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2102 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  56.1 
 
 
216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  58.42 
 
 
235 aa  229  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  55.85 
 
 
203 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  48.6 
 
 
253 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  61.24 
 
 
229 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  45.64 
 
 
286 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  43.58 
 
 
197 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  44.13 
 
 
194 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  47.8 
 
 
208 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  43.89 
 
 
242 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  43.96 
 
 
310 aa  148  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  39.36 
 
 
546 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  41.75 
 
 
277 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  39.06 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  43.02 
 
 
304 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  38.54 
 
 
265 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  38.54 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  44.81 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  34.01 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  38.02 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  55.28 
 
 
197 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  36.5 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  39.78 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  38.83 
 
 
265 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  38.83 
 
 
265 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  38.83 
 
 
265 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  38.83 
 
 
265 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  38.83 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  37.5 
 
 
265 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  47.24 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  40.83 
 
 
165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  42.22 
 
 
231 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  40.98 
 
 
267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  46.72 
 
 
239 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  43.94 
 
 
267 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  51.72 
 
 
228 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  47.9 
 
 
267 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  49.17 
 
 
236 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  34.01 
 
 
222 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  47.9 
 
 
247 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  42.39 
 
 
265 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  47.06 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.06 
 
 
259 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.06 
 
 
253 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  47.06 
 
 
253 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.06 
 
 
253 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.06 
 
 
253 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.06 
 
 
259 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.06 
 
 
259 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.06 
 
 
253 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  47.06 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  46.67 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  39.41 
 
 
201 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  48.82 
 
 
228 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  41.57 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  48.33 
 
 
234 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  47.46 
 
 
185 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  50 
 
 
242 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  47.76 
 
 
225 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  43.44 
 
 
200 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  46.77 
 
 
231 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  43.44 
 
 
200 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
262 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  47.93 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  48.76 
 
 
163 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  47.46 
 
 
239 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  47.58 
 
 
190 aa  96.3  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  38.35 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  32 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  31.58 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  35.59 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  34.17 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  34.29 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  34.92 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  30.77 
 
 
409 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  34.17 
 
 
179 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  35.25 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  31.5 
 
 
429 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  27.92 
 
 
429 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  35.38 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  33.82 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 
375 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  30.58 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  33.07 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  33.07 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  33.87 
 
 
214 aa  58.5  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  32.56 
 
 
391 aa  58.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2341  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2417  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0159574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2568  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2376  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2594  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2612  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000069334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2542  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
142 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0951655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  32.26 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2756  cell wall hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000284234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  35.64 
 
 
488 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  34.13 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  34.13 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>