282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2132 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  68.33 
 
 
222 aa  317  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  45.16 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  42.13 
 
 
264 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  36.68 
 
 
239 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  39.78 
 
 
265 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  38.71 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  38.71 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  38.71 
 
 
265 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  38.71 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  38.17 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  38.17 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  38.17 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  38.17 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  38.17 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  39.89 
 
 
203 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  34.54 
 
 
235 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  34.59 
 
 
242 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  38.62 
 
 
216 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  41.4 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  36.17 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  38.17 
 
 
261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  37.43 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  33.85 
 
 
208 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  27 
 
 
241 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  32.62 
 
 
310 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  38.67 
 
 
231 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  36.05 
 
 
165 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  34.5 
 
 
277 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  31.82 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  30.81 
 
 
546 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  36.07 
 
 
304 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  38.64 
 
 
239 aa  95.5  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  38.4 
 
 
267 aa  94.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  42.07 
 
 
197 aa  95.1  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  35.92 
 
 
267 aa  91.3  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  46.28 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  38.52 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  42.11 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  40.91 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  38.17 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  34.88 
 
 
234 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  37.11 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  35.21 
 
 
267 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  38.02 
 
 
236 aa  84.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  45 
 
 
190 aa  84.7  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  40.34 
 
 
239 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  34.51 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  35.54 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  39.34 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  34.75 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  37.19 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  35.4 
 
 
229 aa  79  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  35.46 
 
 
247 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  36.67 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  37.29 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  28.57 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.33 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.33 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  35.2 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.33 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  33.33 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.33 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  35.2 
 
 
253 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  35.2 
 
 
259 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  35.2 
 
 
259 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  35.2 
 
 
259 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  36.43 
 
 
400 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  45.24 
 
 
341 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  40.26 
 
 
557 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.1 
 
 
797 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  30.88 
 
 
179 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.28 
 
 
270 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  40.58 
 
 
542 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  49.12 
 
 
571 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.54 
 
 
597 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.7 
 
 
637 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  59.52 
 
 
338 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  45.45 
 
 
495 aa  54.7  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 
517 aa  55.1  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.53 
 
 
631 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 
333 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.53 
 
 
593 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  53.06 
 
 
554 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  34.09 
 
 
509 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  42.62 
 
 
563 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  43.86 
 
 
519 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  39.06 
 
 
560 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  42.11 
 
 
520 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  40.62 
 
 
479 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  41.07 
 
 
514 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  38.16 
 
 
509 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  41.18 
 
 
515 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  40.62 
 
 
479 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  40 
 
 
298 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  41.18 
 
 
519 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  41.18 
 
 
515 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  41.18 
 
 
515 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  35.06 
 
 
1556 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>