191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2415 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  58.77 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  63.68 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  54.45 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  59.89 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  44.36 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  50.52 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  53.19 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.94 
 
 		 259 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  51.23 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.19 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  44.19 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.19 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  47.39 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.02 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.19 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.56 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.56 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  43.02 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  52.63 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  64.08 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  43.56 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  43.58 
 
 		 228 aa  178  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  43.7 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  40.89 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  43.54 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  51.28 
 
 		 286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  38.96 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  58.77 
 
 		 546 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  60.53 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  60.34 
 
 		 163 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  55.17 
 
 		 197 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  50.41 
 
 		 165 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  57.76 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  57.76 
 
 		 261 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  49.57 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  51.67 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  56.64 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  41.32 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  52.94 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  49.11 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  37.95 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  49.58 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  45.69 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  47.41 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  45.83 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  46.22 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  34.88 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  34.88 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  34.88 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  34.88 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  34.88 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  40.62 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  39.84 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  36.46 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  43.85 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  55.79 
 
 		 253 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  44.72 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  40.46 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  43.9 
 
 		 265 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  43.08 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  47.41 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  43.97 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  37.19 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  36.36 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  40.91 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  42.02 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  31.69 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  39.37 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  36.3 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  34.68 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  35.59 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  34.68 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  34.92 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  28.95 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  32.56 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  59.57 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  42.35 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  32.31 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  29.66 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  31.5 
 
 		 460 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  32.26 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  57.45 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  32.8 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  28.73 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  37.89 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  29.2 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  28.66 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  32.28 
 
 		 476 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  40.23 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  42.25 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  47.14 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  42.25 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  33.06 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  35.71 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 562 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  27.91 
 
 		 472 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  48.94 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>