130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3463 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  32.68 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  36 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  37.5 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  35.59 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  34.11 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  33.09 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  31.62 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  32.81 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  26.56 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  31.11 
 
 		 446 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  30.94 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  30.94 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  29.5 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  29.71 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  29.5 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  28.78 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  31.01 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  30.77 
 
 		 267 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  33.06 
 
 		 153 aa  62  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  30.43 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  30.71 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  31.54 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  30.47 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  34.33 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  29.17 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  28.46 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  35.35 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  28.12 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  26.61 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  26.83 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  31.09 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  32.82 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  31.45 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  28.81 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  28.23 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  28.06 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  32.82 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  29.23 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  34.04 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  29.66 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  28.8 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  29.1 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  27.64 
 
 		 265 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  26.61 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  26.61 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  27.64 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  30 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  30.17 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  26.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  26.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  26.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  26.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  30.65 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  26.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  28.12 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 		 412 aa  54.3  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  31.01 
 
 		 377 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  26 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 326 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  28 
 
 		 429 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  28.68 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  26.14 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  32.58 
 
 		 460 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  29.31 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  28.45 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  28.69 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  30.16 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  28.21 
 
 		 376 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  27.13 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  28.21 
 
 		 546 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  23.44 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  28.15 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.57 
 
 		 259 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 326 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  28.57 
 
 		 253 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.57 
 
 		 253 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  25 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.57 
 
 		 259 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.57 
 
 		 259 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.57 
 
 		 253 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  28.57 
 
 		 253 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.57 
 
 		 253 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.57 
 
 		 253 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.06 
 
 		 247 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  26.39 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  31.06 
 
 		 466 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  27.09 
 
 		 432 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  29.31 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  28.79 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  26.11 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  29.31 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  27.2 
 
 		 488 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  22.22 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  27.59 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  24.6 
 
 		 264 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>