120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0543 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 
169 aa  348  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  269  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  72.73 
 
 
166 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  79.71 
 
 
169 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  75.69 
 
 
169 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  64.96 
 
 
326 aa  191  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  63.91 
 
 
315 aa  190  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  64.96 
 
 
326 aa  190  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  64.44 
 
 
284 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  56.25 
 
 
287 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  57.36 
 
 
278 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  66.1 
 
 
208 aa  157  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  55.81 
 
 
235 aa  154  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  57.25 
 
 
226 aa  154  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  48.34 
 
 
245 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  53.28 
 
 
245 aa  147  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  53.28 
 
 
245 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  34.71 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  38.24 
 
 
214 aa  67  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  38.95 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  35.19 
 
 
209 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  36.73 
 
 
376 aa  61.6  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  32 
 
 
228 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  33.9 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  31.75 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  34.09 
 
 
466 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  31.75 
 
 
240 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  32.69 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  31.71 
 
 
380 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  32.32 
 
 
230 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  35.92 
 
 
375 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  32.79 
 
 
409 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  34.09 
 
 
460 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  31.63 
 
 
203 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  35.64 
 
 
301 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  33.08 
 
 
245 aa  57.4  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 
301 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 
433 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 
301 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  28.23 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  47.06 
 
 
410 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  36.27 
 
 
402 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  28.71 
 
 
229 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  36.27 
 
 
409 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  30.71 
 
 
255 aa  54.3  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 
365 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 
474 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  30.19 
 
 
217 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  30.19 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  48 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  51.11 
 
 
432 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  34.62 
 
 
476 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  35.64 
 
 
286 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  30.4 
 
 
429 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  33.01 
 
 
429 aa  52  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 
476 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  48.94 
 
 
496 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 
446 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  31.03 
 
 
310 aa  51.2  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  41.51 
 
 
187 aa  50.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  32.28 
 
 
472 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  38.46 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  37.74 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  32.63 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  44.23 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 
391 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  25.62 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  30.48 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  27.14 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.21 
 
 
259 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.21 
 
 
253 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  30.21 
 
 
253 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  30.21 
 
 
253 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.21 
 
 
253 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.21 
 
 
259 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.21 
 
 
259 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.21 
 
 
253 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.21 
 
 
253 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  30.4 
 
 
377 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  44.68 
 
 
404 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  30.21 
 
 
259 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  37.8 
 
 
231 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  38.6 
 
 
412 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  32.69 
 
 
208 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  30.39 
 
 
277 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  31.52 
 
 
229 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  34.62 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.17 
 
 
247 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  36.73 
 
 
235 aa  45.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  37.18 
 
 
546 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  31.46 
 
 
383 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5334  hypothetical protein  31.07 
 
 
300 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632965  normal  0.811239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  34.52 
 
 
233 aa  44.7  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5166  cell wall hydrolase SleB  30.69 
 
 
250 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847272  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  35.94 
 
 
242 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  34.33 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  30 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 
400 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  40.54 
 
 
304 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  29.66 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>