More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1096 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 
304 aa  620  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  55.22 
 
 
253 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  47.92 
 
 
267 aa  205  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  42.13 
 
 
277 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  49.18 
 
 
208 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  45.59 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35.58 
 
 
546 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  43.78 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  43.26 
 
 
239 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  33.47 
 
 
265 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  33.9 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  33.9 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  33.9 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  33.9 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  33.47 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  34.32 
 
 
265 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  33.9 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  33.47 
 
 
265 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  36.4 
 
 
264 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  33.9 
 
 
265 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  39.55 
 
 
216 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  31.91 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  42.31 
 
 
197 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  40.41 
 
 
324 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  40.66 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  36.55 
 
 
265 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  32.63 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  43.02 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 
733 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.72 
 
 
327 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  40.7 
 
 
307 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  38.55 
 
 
445 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  36.52 
 
 
235 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  40.26 
 
 
596 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  44.23 
 
 
231 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.07 
 
 
612 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  38.07 
 
 
612 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.14 
 
 
470 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
661 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  42.35 
 
 
444 aa  99.8  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  43.71 
 
 
239 aa  99  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.96 
 
 
797 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  30.63 
 
 
241 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
405 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  30.23 
 
 
423 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  42.36 
 
 
229 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  32.92 
 
 
242 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  38.07 
 
 
334 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  36.07 
 
 
216 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  38.07 
 
 
334 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  36.13 
 
 
242 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  34.21 
 
 
228 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  31.87 
 
 
409 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  33.52 
 
 
1079 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 
547 aa  92.8  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 
620 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.85 
 
 
617 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  36.13 
 
 
234 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  34.43 
 
 
390 aa  89.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  41.71 
 
 
228 aa  89.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  31.14 
 
 
361 aa  89  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  50.53 
 
 
503 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  30.85 
 
 
222 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 
840 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  36.02 
 
 
695 aa  85.9  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  51 
 
 
163 aa  85.5  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  36.3 
 
 
165 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  41.77 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  32.93 
 
 
495 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  37.6 
 
 
185 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  35.91 
 
 
527 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30.65 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.72 
 
 
1001 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  42.98 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  31.18 
 
 
390 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  30.89 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  29.69 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.71 
 
 
576 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.98 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.2 
 
 
544 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  33.91 
 
 
595 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 
539 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  28.34 
 
 
1021 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 
236 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 
201 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  35.43 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  43.01 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  40.91 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  42.61 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  30.19 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  34.53 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  39.67 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.66 
 
 
509 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  35.24 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.95 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.07 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>