239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_20080 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  100 
 
 
695 aa  1369    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.98 
 
 
636 aa  204  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  35.43 
 
 
928 aa  197  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.73 
 
 
502 aa  178  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.93 
 
 
591 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.89 
 
 
905 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  31.46 
 
 
539 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.96 
 
 
728 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.53 
 
 
959 aa  161  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  42.21 
 
 
654 aa  161  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.71 
 
 
387 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  32.89 
 
 
537 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  32.89 
 
 
537 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  32.89 
 
 
537 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  31.96 
 
 
539 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  39.3 
 
 
370 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.84 
 
 
694 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  37.91 
 
 
541 aa  152  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  40.29 
 
 
879 aa  143  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  47.8 
 
 
390 aa  140  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.11 
 
 
794 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  65.71 
 
 
292 aa  134  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.31 
 
 
784 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.61 
 
 
552 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 
620 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.38 
 
 
617 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  27.13 
 
 
423 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.71 
 
 
684 aa  97.4  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.5 
 
 
964 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.58 
 
 
950 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.34 
 
 
964 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  36.02 
 
 
304 aa  90.1  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.73 
 
 
353 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.15 
 
 
1072 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.5 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  30.04 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  30.6 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.34 
 
 
542 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  25.97 
 
 
546 aa  79.7  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.28 
 
 
327 aa  79  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  25.41 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  30.99 
 
 
539 aa  77.4  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  34.62 
 
 
341 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  29.43 
 
 
612 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.43 
 
 
612 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.06 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  37.59 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  29.74 
 
 
390 aa  73.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  28.32 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  28.32 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  25.33 
 
 
595 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  30.05 
 
 
1079 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 
733 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  29.07 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.26 
 
 
1001 aa  68.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  28.49 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.57 
 
 
223 aa  68.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  31.05 
 
 
1021 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.16 
 
 
797 aa  68.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  36.54 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  29 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  38.32 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  27.72 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  25 
 
 
602 aa  66.6  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.75 
 
 
268 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
301 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  27.57 
 
 
527 aa  65.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  27.91 
 
 
391 aa  65.1  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  29.93 
 
 
342 aa  64.7  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  32.46 
 
 
277 aa  64.3  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.36 
 
 
277 aa  64.3  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25 
 
 
357 aa  63.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  33.14 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.45 
 
 
534 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.27 
 
 
364 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  32.31 
 
 
298 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  22.22 
 
 
661 aa  63.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.39 
 
 
303 aa  62.4  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  29.21 
 
 
399 aa  62  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  25.42 
 
 
495 aa  62.4  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  25.79 
 
 
289 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  22.95 
 
 
509 aa  61.6  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.02 
 
 
515 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  33.33 
 
 
515 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  27.7 
 
 
223 aa  61.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  26.29 
 
 
338 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  22.41 
 
 
446 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 
405 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  30.39 
 
 
257 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.91 
 
 
840 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  28.06 
 
 
555 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 
498 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  31.33 
 
 
307 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  28.81 
 
 
283 aa  58.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  31.36 
 
 
342 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  32.48 
 
 
503 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  33.67 
 
 
253 aa  57.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  29.31 
 
 
518 aa  57.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  29.36 
 
 
495 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>