More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_13740 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  100 
 
 		 390 aa  776    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  38.23 
 
 		 399 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 440 aa  216  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  34.6 
 
 		 414 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  30.94 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  34.37 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  49.72 
 
 		 695 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.7 
 
 		 617 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.97 
 
 		 292 aa  95.5  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  29.47 
 
 		 423 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  34.43 
 
 		 304 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  31.05 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  33.7 
 
 		 612 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.7 
 
 		 612 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  36.46 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  25.6 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  31.09 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.46 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  31.28 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 		 733 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  31.47 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  30.85 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  33.68 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 327 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  31.07 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.1 
 
 		 1001 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  27.66 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  31.22 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  27.46 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  29.71 
 
 		 527 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 1021 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.55 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  27.37 
 
 		 546 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  35.25 
 
 		 277 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  28.57 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  35.43 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  27.59 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  34.86 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  24.07 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  27.42 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  27.42 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.25 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  32.26 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  27.09 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  22.9 
 
 		 661 aa  63.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  27.8 
 
 		 1079 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.64 
 
 		 543 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  27.67 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.3 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  25.45 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  26.6 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  27.8 
 
 		 539 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  30.47 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  36.94 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  32.87 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  24.62 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  39.69 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.22 
 
 		 840 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  29.17 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  28.8 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  25.56 
 
 		 179 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  28.12 
 
 		 154 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  32.67 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  28.35 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  25.97 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  26.34 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  37.96 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.51 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  25.85 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  34.15 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  28.14 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  31.75 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  35.34 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  32 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  32.59 
 
 		 281 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.85 
 
 		 282 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  30.95 
 
 		 495 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.06 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  30.28 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.57 
 
 		 534 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  26.42 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  32.87 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  25.48 
 
 		 570 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  26.13 
 
 		 553 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  34 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>