272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1153 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 
429 aa  874    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  89.29 
 
 
448 aa  807    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1628  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.52 
 
 
363 aa  96.3  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000128844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0632  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.48 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0695  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.48 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  46.79 
 
 
568 aa  84.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.61 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  27.09 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  40.91 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  42.11 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  43.81 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  40.59 
 
 
499 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  39.05 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  39.13 
 
 
324 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  40 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
661 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.89 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  32.92 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  32.14 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  36.63 
 
 
250 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  36.36 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  42.2 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  42.2 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  28.93 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.8 
 
 
954 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  35 
 
 
633 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  38.6 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.86 
 
 
327 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  39.39 
 
 
307 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  39.6 
 
 
142 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  35.64 
 
 
284 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  26.2 
 
 
1021 aa  63.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  36.84 
 
 
1556 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  40.38 
 
 
301 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  37.38 
 
 
255 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  40.21 
 
 
428 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  37.61 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  39.25 
 
 
361 aa  62.4  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  41.84 
 
 
267 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  39.45 
 
 
733 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  35.04 
 
 
522 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 
1079 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.07 
 
 
1001 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
444 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  33.33 
 
 
335 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.51 
 
 
289 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.13 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  38.83 
 
 
495 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.34 
 
 
617 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.13 
 
 
457 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  31.07 
 
 
253 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  37.11 
 
 
546 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
368 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  26.39 
 
 
256 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  31.63 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  31.53 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  36.27 
 
 
112 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  33.91 
 
 
1147 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  38.14 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  30.19 
 
 
287 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  40.82 
 
 
290 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  33.05 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 
314 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  55.81 
 
 
590 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  60.87 
 
 
184 aa  54.3  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  26.17 
 
 
301 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  33.33 
 
 
395 aa  54.3  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.74 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.74 
 
 
406 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.74 
 
 
406 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.74 
 
 
455 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.74 
 
 
406 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  53.49 
 
 
204 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  40.91 
 
 
285 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 
511 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  34.29 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  34 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  60.47 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  35.35 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.31 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
409 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.01 
 
 
797 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 
596 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.08 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  34.45 
 
 
445 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  30.91 
 
 
298 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  35.79 
 
 
323 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  27.35 
 
 
509 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  32.39 
 
 
285 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  33.66 
 
 
515 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  39.18 
 
 
289 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.8 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  52.27 
 
 
128 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.14 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.14 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.14 
 
 
452 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  36.89 
 
 
324 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>