288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3244 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 		 320 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 399 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 496 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  31.77 
 
 		 252 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.64 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  30.93 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  31.55 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  30.93 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.64 
 
 		 448 aa  82.8  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  35.12 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.79 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  29.91 
 
 		 574 aa  76.3  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  33.67 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.78 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.7 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  33.09 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  42.16 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  29.47 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  33.94 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  43 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  38.54 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  31.65 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  26.6 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  27.93 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  32.14 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  27.86 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  34.34 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.81 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  30.41 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  26.29 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  29.61 
 
 		 935 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.7 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  27.88 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  34.69 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  34.91 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  27.64 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.62 
 
 		 546 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  27.92 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.39 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  34.48 
 
 		 123 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 503 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  27.93 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  29.29 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  27.93 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  32 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.81 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  31.13 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  27.33 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.86 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  27.67 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  29.65 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  36.36 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  27.48 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.02 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  32.99 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.63 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  27.43 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  35.35 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  35.96 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  35.45 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.93 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.11 
 
 		 954 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  38.78 
 
 		 633 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  34.78 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  35.65 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  27.43 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  29.44 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0324  muramidase  45.07 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  29.24 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  31.34 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  33.33 
 
 		 1556 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  25.6 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  26.02 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  33.9 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  31.52 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  29.57 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  27.69 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  34.26 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 		 797 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  53.7 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  27.43 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  31.63 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 829 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  33.03 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.04 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.59 
 
 		 617 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  26.53 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  29.58 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  31.31 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.25 
 
 		 470 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>