26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0695 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0632  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 		 310 aa  640    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0695  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 		 310 aa  640    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  48.62 
 
 		 487 aa  298  6e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1628  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  35.59 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000128844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.48 
 
 		 429 aa  92.4  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.23 
 
 		 448 aa  85.9  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0224  hypothetical protein  35.19 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  29.57 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  30.59 
 
 		 240 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 496 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5643  glycoside hydrolase family 25  28.37 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.27 
 
 		 437 aa  50.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  29.9 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  26.76 
 
 		 207 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  22.22 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  26.24 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  31.4 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  22.22 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.16 
 
 		 669 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  21.53 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  41.67 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  28.23 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  37.66 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.94 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.14 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.530239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>