233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_03571 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  88.14 
 
 		 253 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  74.7 
 
 		 256 aa  358  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  55.73 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  32.7 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  25.75 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  23.44 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  28.12 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  31.94 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  28.87 
 
 		 428 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  28.74 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.78 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  27.78 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  28.99 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  28.12 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  30.5 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.17 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  26.92 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  35.64 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  26.56 
 
 		 544 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  29.58 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  28.37 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  31.01 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.87 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  29.55 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.62 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.33 
 
 		 532 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  29.69 
 
 		 518 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  32.79 
 
 		 409 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  28.57 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.25 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.33 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  29.25 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 849 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.45 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.17 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  32.74 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  30.17 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  27.34 
 
 		 620 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  27.08 
 
 		 515 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  26.9 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  36.45 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  36.45 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  36.45 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  36.45 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  36.45 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  29.03 
 
 		 650 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  36.45 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  29.71 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  27.93 
 
 		 539 aa  55.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  29.81 
 
 		 524 aa  55.5  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  35.51 
 
 		 430 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  21.94 
 
 		 556 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  29.52 
 
 		 553 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  35.51 
 
 		 430 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  26.9 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.36 
 
 		 528 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  24.31 
 
 		 499 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  35.78 
 
 		 419 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.81 
 
 		 543 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  28.45 
 
 		 563 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  24.31 
 
 		 487 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  34.82 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  33.04 
 
 		 430 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  35.51 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.52 
 
 		 801 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  32.69 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 595 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  34.55 
 
 		 571 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  29.03 
 
 		 514 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  32.69 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  32.71 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  25.12 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  23.91 
 
 		 414 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  26.79 
 
 		 390 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  34.58 
 
 		 430 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  26.56 
 
 		 542 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  27.34 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  25.71 
 
 		 560 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  26.81 
 
 		 515 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 546 aa  52.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.79 
 
 		 581 aa  52.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  26.39 
 
 		 515 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  26.52 
 
 		 1556 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3128  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  44.44 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  28.97 
 
 		 557 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.93 
 
 		 679 aa  51.6  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  26.81 
 
 		 515 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  34.48 
 
 		 128 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  26.81 
 
 		 519 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  26.81 
 
 		 515 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  30.3 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  28.44 
 
 		 394 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>