More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0644 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 
679 aa  1352    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  26.49 
 
 
733 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  28.62 
 
 
499 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  28.62 
 
 
546 aa  94.7  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  32.95 
 
 
527 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.93 
 
 
840 aa  84.7  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 
580 aa  85.1  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.13 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  23.89 
 
 
620 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  29.1 
 
 
556 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.57 
 
 
554 aa  79.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  24.92 
 
 
661 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  24.21 
 
 
509 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.2 
 
 
517 aa  77.8  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.58 
 
 
528 aa  77.4  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  27.43 
 
 
446 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  30.51 
 
 
517 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  28.26 
 
 
539 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.31 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  28.37 
 
 
596 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.64 
 
 
532 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  28.31 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  30.43 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  27.38 
 
 
602 aa  74.3  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.61 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.52 
 
 
797 aa  73.9  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  25.44 
 
 
1021 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.39 
 
 
527 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.66 
 
 
515 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.04 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.29 
 
 
518 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  26.99 
 
 
849 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  29.34 
 
 
571 aa  72  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  26.55 
 
 
518 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  26.89 
 
 
570 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.95 
 
 
289 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  28.41 
 
 
515 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  29.38 
 
 
430 aa  70.1  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  27.81 
 
 
515 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  27.93 
 
 
515 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  37.17 
 
 
301 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  31.79 
 
 
511 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  24.58 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  27.09 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.88 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  26.88 
 
 
515 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.59 
 
 
576 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  28.02 
 
 
519 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  27.38 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  31.15 
 
 
524 aa  68.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.22 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  27.84 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  27.84 
 
 
519 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  27.27 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  24.38 
 
 
612 aa  68.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  24.38 
 
 
612 aa  68.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  25.99 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  27.27 
 
 
515 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  27.4 
 
 
314 aa  67  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  28.14 
 
 
544 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  37.1 
 
 
523 aa  65.1  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  39.5 
 
 
495 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  26.4 
 
 
517 aa  65.1  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.74 
 
 
581 aa  64.7  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  22.8 
 
 
1001 aa  63.9  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  28.77 
 
 
638 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  27.81 
 
 
553 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.41 
 
 
552 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.67 
 
 
801 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  27.33 
 
 
414 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  27.32 
 
 
173 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  31.91 
 
 
342 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  26.37 
 
 
550 aa  62.4  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
346 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.1 
 
 
617 aa  62  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 
499 aa  61.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.09 
 
 
327 aa  61.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.67 
 
 
455 aa  60.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  30.65 
 
 
287 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  26.54 
 
 
337 aa  60.8  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.67 
 
 
406 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.67 
 
 
406 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.67 
 
 
406 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  25.14 
 
 
546 aa  60.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.67 
 
 
406 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  26.59 
 
 
479 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 
405 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
474 aa  59.7  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  22.81 
 
 
650 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  24.64 
 
 
587 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  27.4 
 
 
547 aa  58.9  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  31.91 
 
 
403 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  23.49 
 
 
402 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  28.48 
 
 
389 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  30.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.69 
 
 
303 aa  57.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  30.23 
 
 
506 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  26.59 
 
 
479 aa  57.4  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>