More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0689 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  79.03 
 
 
266 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  49.38 
 
 
324 aa  228  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  46.28 
 
 
334 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  46.28 
 
 
334 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  65.42 
 
 
300 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  65.42 
 
 
300 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  56.36 
 
 
157 aa  129  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  53.27 
 
 
156 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  35.11 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  35.11 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  58.33 
 
 
267 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  58.33 
 
 
267 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  35.12 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  56.14 
 
 
166 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  56.14 
 
 
166 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  56.78 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  56.78 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  55.14 
 
 
257 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  55.14 
 
 
257 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  43.93 
 
 
143 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  43.93 
 
 
143 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  45.37 
 
 
143 aa  95.9  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  38.61 
 
 
381 aa  92.8  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  41.59 
 
 
449 aa  88.2  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  36.23 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.53 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 
542 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  36.92 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  38.18 
 
 
557 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  36.52 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  36.28 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  36.22 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 
655 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 
596 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.82 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.82 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  40.48 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  35.24 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  39.45 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  33.11 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  34.53 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  36.79 
 
 
301 aa  72  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  30.26 
 
 
409 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  29.08 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  35.9 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.25 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  34.53 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.52 
 
 
554 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  34.06 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  32.61 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  32.61 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  32.61 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.39 
 
 
631 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  32.61 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  33.83 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  31.88 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.52 
 
 
637 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.61 
 
 
593 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  37.74 
 
 
661 aa  69.3  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  34.55 
 
 
512 aa  68.6  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  40.37 
 
 
582 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.54 
 
 
840 aa  68.9  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  44.86 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  30.73 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  31.82 
 
 
544 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 
527 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.25 
 
 
354 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.02 
 
 
797 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  32.61 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  34.23 
 
 
563 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  33.06 
 
 
560 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.38 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  37.74 
 
 
570 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.86 
 
 
574 aa  65.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  40.48 
 
 
482 aa  65.9  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  33.33 
 
 
933 aa  65.5  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  36.45 
 
 
733 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.79 
 
 
576 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 
579 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 
595 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  34.82 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 
620 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  39.83 
 
 
499 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 
498 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  38 
 
 
389 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  34.91 
 
 
503 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  28.97 
 
 
323 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  34.29 
 
 
546 aa  62.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  35.96 
 
 
142 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  38.2 
 
 
390 aa  62.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  35.85 
 
 
571 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.85 
 
 
581 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  30.58 
 
 
346 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  34.21 
 
 
514 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>