180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1430 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  100 
 
 
397 aa  732    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  48.03 
 
 
157 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.19 
 
 
655 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  53.33 
 
 
447 aa  90.9  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  35.53 
 
 
455 aa  90.1  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  35.89 
 
 
466 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  29.66 
 
 
324 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  41.82 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.56 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.56 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  45.24 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  43.41 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  27.18 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  27.18 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  42.74 
 
 
265 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  42.74 
 
 
265 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  37.93 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  39.06 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  43.3 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  38.41 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  40.34 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  40.34 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  29.52 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  29.52 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  38.94 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 
620 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  41.12 
 
 
512 aa  69.7  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  36.28 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0324  muramidase  39.22 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  43 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  45.83 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  30.08 
 
 
301 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  46.22 
 
 
257 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  46.22 
 
 
257 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  30.39 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  43.1 
 
 
166 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  44.88 
 
 
255 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  43.1 
 
 
166 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  44.88 
 
 
255 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.4 
 
 
509 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 
409 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.33 
 
 
544 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 
547 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  42.53 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  42.52 
 
 
267 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  42.22 
 
 
279 aa  60.8  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  42.52 
 
 
267 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  35.59 
 
 
445 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.78 
 
 
574 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  31.07 
 
 
612 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.07 
 
 
612 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  28.63 
 
 
465 aa  59.7  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  38.74 
 
 
143 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  38.74 
 
 
143 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  33.06 
 
 
341 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  32.21 
 
 
265 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  34.84 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  29.17 
 
 
277 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  38.74 
 
 
143 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  37.5 
 
 
515 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.83 
 
 
568 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.43 
 
 
470 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  31.97 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  36.94 
 
 
582 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.4 
 
 
327 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  34.33 
 
 
514 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  32.45 
 
 
265 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  27.89 
 
 
556 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.61 
 
 
303 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.61 
 
 
285 aa  57  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  37.93 
 
 
635 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  38.28 
 
 
515 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  26.45 
 
 
142 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  44.92 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  35.59 
 
 
443 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  27.12 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  35.96 
 
 
482 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  34.09 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  38.28 
 
 
515 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  37.37 
 
 
933 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  26.73 
 
 
338 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  28.28 
 
 
255 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  41.49 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  30.87 
 
 
264 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  31.54 
 
 
265 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  34.78 
 
 
557 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  31.79 
 
 
265 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  30.38 
 
 
274 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  26.06 
 
 
539 aa  53.5  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  42.7 
 
 
303 aa  53.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  30.95 
 
 
253 aa  53.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  27.05 
 
 
553 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  40.5 
 
 
361 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 
511 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  29.33 
 
 
265 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  29.33 
 
 
265 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  29.33 
 
 
265 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  29.52 
 
 
250 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  35.1 
 
 
414 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  31.43 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>