56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1884 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  100 
 
 		 157 aa  318  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  63.86 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  63.86 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  66.39 
 
 		 257 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  66.39 
 
 		 257 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  66.06 
 
 		 267 aa  144  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  66.06 
 
 		 267 aa  144  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  62.39 
 
 		 255 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  62.39 
 
 		 255 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  54.84 
 
 		 266 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  56.36 
 
 		 265 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  56.36 
 
 		 265 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  57.94 
 
 		 300 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  57.94 
 
 		 300 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  56.78 
 
 		 266 aa  124  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  55.26 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  55.26 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  47.66 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  48.18 
 
 		 324 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  34.81 
 
 		 143 aa  97.1  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  50.47 
 
 		 334 aa  94.4  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  50.47 
 
 		 334 aa  94.4  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  31.65 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  31.65 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.96 
 
 		 655 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.64 
 
 		 619 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.64 
 
 		 619 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  40.34 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  49.04 
 
 		 397 aa  78.2  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  42.98 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.34 
 
 		 574 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  45.65 
 
 		 447 aa  72  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  37.86 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  45.35 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  43.62 
 
 		 455 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  40.59 
 
 		 933 aa  65.1  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  43.01 
 
 		 499 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  37.36 
 
 		 468 aa  61.6  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  35.14 
 
 		 512 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  35.66 
 
 		 582 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  34.56 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  33.64 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  31.82 
 
 		 303 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2130  CHAP domain-containing protein  32.14 
 
 		 288 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0066022  normal  0.0961309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  30.97 
 
 		 482 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  36.67 
 
 		 279 aa  48.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  35.16 
 
 		 279 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0046  CHAP domain containing protein  29.51 
 
 		 332 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5951  CHAP domain-containing protein  38.04 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 358 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 360 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  38.27 
 
 		 562 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5979  CHAP domain-containing protein  40 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2696  CHAP  26.73 
 
 		 222 aa  43.9  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  30.11 
 
 		 357 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  37.27 
 
 		 446 aa  41.2  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>