36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2380 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  100 
 
 		 582 aa  1189    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  40 
 
 		 266 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  40.37 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  40.37 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  37.61 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  37.61 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  47.06 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  47.06 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  35.66 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  36.84 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  39.08 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  36.04 
 
 		 266 aa  57  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  36.27 
 
 		 449 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  35.29 
 
 		 143 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  35.29 
 
 		 143 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  38.46 
 
 		 334 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  38.46 
 
 		 334 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  36.94 
 
 		 397 aa  54.3  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  38.24 
 
 		 143 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  33.72 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.52 
 
 		 619 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.52 
 
 		 619 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  38.82 
 
 		 512 aa  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  38.82 
 
 		 390 aa  52.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.96 
 
 		 655 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  38.18 
 
 		 279 aa  47  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  33.04 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  32.94 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  29.17 
 
 		 360 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  34.88 
 
 		 303 aa  46.2  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  32.29 
 
 		 933 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  36.61 
 
 		 166 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  36.61 
 
 		 166 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  34.94 
 
 		 447 aa  44.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 789 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  39.53 
 
 		 318 aa  44.3  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>