48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2120 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  70.63 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  70.63 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  46.3 
 
 		 266 aa  100  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  34.81 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  45.37 
 
 		 265 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  45.37 
 
 		 265 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  43.75 
 
 		 266 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  40.17 
 
 		 300 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  40.17 
 
 		 300 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  30.41 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  41.67 
 
 		 324 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  42.73 
 
 		 482 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  46.99 
 
 		 279 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  46.99 
 
 		 279 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  41.86 
 
 		 257 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  41.86 
 
 		 257 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  44.14 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  44.86 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  44.14 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  44.86 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  43.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  43.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  44.32 
 
 		 468 aa  72  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  32.45 
 
 		 318 aa  71.6  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  34.51 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.78 
 
 		 619 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  35.64 
 
 		 449 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.78 
 
 		 619 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  40.74 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  40.74 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.86 
 
 		 655 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  41.24 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  37.8 
 
 		 390 aa  61.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  36.7 
 
 		 933 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  36.11 
 
 		 512 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.11 
 
 		 574 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  30.6 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  37.65 
 
 		 499 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  38.95 
 
 		 455 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  38.1 
 
 		 397 aa  54.3  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  33.33 
 
 		 303 aa  53.9  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  38.24 
 
 		 582 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1107  CHAP  38.55 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00855141  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  34.57 
 
 		 302 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2297  hypothetical protein  35.63 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  32.98 
 
 		 357 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  40.3 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>