53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2327 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  330  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  330  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  65.87 
 
 
157 aa  222  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  61.48 
 
 
257 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  61.48 
 
 
257 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  63.85 
 
 
267 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  63.85 
 
 
267 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  59.82 
 
 
300 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  59.82 
 
 
300 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  52.8 
 
 
266 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  59.23 
 
 
255 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  59.23 
 
 
255 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  56.14 
 
 
265 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  56.14 
 
 
265 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  50.7 
 
 
266 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  49.28 
 
 
279 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  49.28 
 
 
279 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  48.6 
 
 
156 aa  120  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  48.6 
 
 
324 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  40.62 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  39.29 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  39.29 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  46.34 
 
 
334 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  46.34 
 
 
334 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.55 
 
 
619 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.55 
 
 
619 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 
655 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  41.03 
 
 
381 aa  77.4  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  40.35 
 
 
449 aa  75.9  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  43.27 
 
 
397 aa  70.9  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  40.87 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.74 
 
 
574 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  37.1 
 
 
512 aa  67.4  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  42.53 
 
 
447 aa  65.1  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  37.7 
 
 
468 aa  65.1  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  45.24 
 
 
455 aa  65.1  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  42.39 
 
 
499 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  43.53 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  39.6 
 
 
933 aa  60.8  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  36.61 
 
 
582 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  31.72 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  30.17 
 
 
390 aa  53.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2130  CHAP domain-containing protein  42.05 
 
 
288 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0066022  normal  0.0961309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  31.58 
 
 
482 aa  48.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  41.86 
 
 
279 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2696  CHAP  30.69 
 
 
222 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  31.25 
 
 
303 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  39.09 
 
 
446 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5979  CHAP domain-containing protein  42.31 
 
 
251 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2297  hypothetical protein  28.04 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  37.89 
 
 
562 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5951  CHAP domain-containing protein  35.77 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  35.96 
 
 
279 aa  41.6  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>